Wie bei vielen anderen reinen Rassen gab es auch bei der Perserkatze Herausforderungen und Kontroversen, insbesondere in Bezug auf ihre Zucht und Gesundheit. Die flache Schnauze der Perserkatze, ein Merkmal, das für ihr charakteristisches Aussehen verantwortlich ist, hat auch zu gesundheitlichen Problemen geführt. Atemwegserkrankungen, Zahnprobleme und Augenprobleme sind bei Perserkatzen häufiger als bei anderen Rassen. Die Züchtergemeinschaft hat daher begonnen, Gesundheitsprüfungen und züchterische Richtlinien einzuführen, um das Wohlbefinden der Katzen zu gewährleisten.

Ein weiterer Bereich der Diskussion ist die ethische Zuchtpraxis. Es gibt Bedenken, dass bestimmte Zuchtpraktiken das Wohl der Tiere beeinträchtigen können. Die moderne Züchtergemeinschaft arbeitet daran, diese Probleme anzugehen und sicherzustellen, dass die Gesundheit und das Wohlbefinden der Perserkatzen oberste Priorität haben.