Auf der US-Marinebasis in Pearl Harbor wurden ausländische Waffen in einem Container gefunden. Der NCIS auf Ohau wird über den Fund informiert und beginnt zu ermitteln. Als unerwartet das FBI auftaucht, müssen beide Ermittlerteams zusammenarbeiten. Gemeinsam sind sie einem japanischen Yakuza-Clan auf der Spur, der illegale Waffen auf die Insel bringt...