Aus einem Stützpunkt des US Marine Corps wurden mehrere Kisten mit Waffen und Sprengstoff gestohlen. Der NCIS Sam Diego übernimmt sofort die Ermittlungen und soll  verhindern, dass die brisanten Gegenstände auf dem Schwarzmarkt landen. Als die Spur zu einem Gangsterboss führt, gerät das Team unerwartet mit dem FBI aneinander, das ebenfalls hinter dem Verbrecher her ist...